雲程眉批：
1. 這單位有趣之處是其產生的原因：「為確保台、澎光復區之治安 與主權，並處理軍事受降與接收、遣俘等事宜」，明白的顯示「台灣省警備總司令部」是個「佔領軍事政府」。後來，卻變成特務機關。
2. 其沿革非常複雜，或許有意的複雜模糊化。如果，任何人「一下子」就能看出其權力移轉的軸線，我喝醬油一杯表示拜服。
■沿革Last Updated Time:2006/09/15
「國防部後備司令部」是一個負有光榮使命、歷史傳承的軍事單位。本部自民國三十四年九月一日（1945.09.01）於重慶市成立「台灣省警備總司令部」起；「警備治安、動員管理」為本部自初肇時期至今所賦不變任務，隨後因時代脈動與潮流所趨，本部組織調整，於任務上增加「海岸巡防及後備軍人組訓與服務工作」以應時需，茲陳述如后：
■34年—53（1945～1964）年，任務：警備治安為主，動員管理為副：
（一）警備治安：
民國三十四年八月，對日抗戰勝利後，台澎列島，重歸祖國，全體軍民，無不珍視。中樞為確保台、澎光復區之治安 與主權，並處理軍事受降與接收、遣俘等事宜，於同年九月一日，在重慶市正式成立「台灣省警備總司令部」，並派台灣行政長官陳儀上將兼任總司令，民國三十六年春，奉國民政府主席冬電，「台灣省警備總司令部」，改為「台灣全省警備總司令部」，由高雄要塞司令彭孟緝將軍出任司令，歸台灣省政府主席指揮。同年五月十日，於台北市上海路正式辦公。
民國三十八（1949）年初，因應戡亂作戰重任，特派陳誠將軍主持台灣省政，將「台灣全省警備總司令部」改為「台灣省警備總司令部」，總司令一職，由省政府主席兼任，彭孟緝將軍副之。
同年二月，於台北市博愛路「台灣全省警備總司令部」原址編成後，隸屬國防部。
民國三十八年秋（1949.09.01），「台灣省警備總司令部」奉命裁撤，分別成立「東南軍政長官公署」及「台灣省保安司令部」，任命彭孟緝中將為保安司令。同年九月一日正式編組完成。
民國四十七年五月（1958.05），中樞為厲行精簡及 統一指揮機構，將「台灣防衛總司令部」、「台灣省保安司令部」、「台灣省民防司令部」及「台北衛戌總司令部」等四個單位，以「保安司令部」為基礎合併編成「台灣警備總司令部」。以北、中、南、東四個「師管部」編成「地區警備司令部」，執行轄區內有關警備作戰之責；嗣因任務需要，九月十六日在各地區警備司令部之下，以各縣、市團管部（兼任）成立十七個警備分區指揮部，負責轄區內之警備、民防、戒嚴任務之指導、協調及執行。
爾後中樞調整動員體制，於民國五十三年七月一日（1964.07.01）新編成立「台灣軍管區司令部」，「軍管區司令」由「台灣警備總司令部總司令」兼任，全銜為「台灣警備總司令部兼軍管區司令部」，其任務性質除軍事外，兼及政治、經濟，主要為執行推動警備、保安、民防、動員四大工作。
（二）動員管理：
我國兵役法於民國廿二年六月十七日公佈，至廿五年三月一日起付諸實施。
廿六年因軍事動員需要，在蘇、浙、豫、鄂、皖、贛、湘、陜八省，設八個兵役管區，廿五個師管區，五十六團管區，並於省、縣、市設國民軍訓委員會。
民國廿八年二月為適應全面抗戰，各省兵役管區與國民軍訓委員會合併，改組為軍、師、團管區司令部。
卅五年六月重新劃分全國為十七個軍管區，六十個師管區，一九九個團管區，負責兵員徵訓工作；後因內亂兵員徵訓困難，乃於卅八年悉數改組。
台灣光復以後，於民國卅六（1947）年設置師管區，下轄基隆、台中、台南等三個團管區，民國卅八年一月師、團管區撤銷，改設軍管區，省主席兼軍管區司令，旋於四月撤銷，改由警備總部設置兵役處，同年八月再行撤銷，兵役業務仍歸省政府辦理。
民國四十年，國防部特設動員局，恢復成立師、團管區；並依軍事動員體制需要，按省行政區域分設台北、台中、 台南 、台東四個師管區。
民國四十一年五月，分別以陸軍五十六師司令部及一六六、 一六八、一九九等三個團之幹部，與部分士兵編成台北師管區司令部」，下轄宜蘭、基 隆、台北、桃園、新竹等團管區。以陸軍八十七軍軍部，及二一一師司令部之 幹部編成台中師管區司令部」，下轄苗栗、台中、台中市、彰化、嘉義、南投、雲林等團管部 。
以陸軍六十四、九十六、十六等師之超額人員編成「台南師管區司令部」，下轄台南、台南市、高雄，屏東、澎湖等團管區。同年八月，以陸軍第八與五十師之幹部為主，與之編成「台東師管部」（於八十九年二月一日裁撤），下轄花蓮、台東兩個團管部（澎湖於民國四十六年 設置），台北市、高雄市兩個團管部直隸國防部動員局。每一縣市設立一個團管區，專司後備軍人管理、 政訓、與動員工作。
■53年—81年（1964～1992），任務：
警備治安、動員後管並加強後備軍人組訓工作：民國五十三年七月一日國防部裁撤動員局，成立「台灣軍管區司令部」，由「台灣警備總司令部」兼任，下設動員處與後備軍人管理處及政訓處（隸屬政戰部），指揮師、團管區，執行台灣地區兵役動員工作及推動後備軍人組織、宣傳、社調、服務等四大組（政）訓工作，以奠定後備動員基礎，有效經營戰爭面。
■81年—89年（1992～2000），兼任海岸巡防，警備作戰轉為戰時任務：
民國八十一年八月一日因應動員戡亂時期終止，裁撤「台灣警備總司令部」，並成立「海岸巡防司令部」編組四個地區海巡部、下轄八個指揮部、二十七個海巡營，接替海岸巡防任務，全銜為「台灣軍管區司令部兼海岸巡防司令部」；同年（1992）十一月一日奉國防部核定將「台灣軍管區司令部更名為「軍管區司令部」，本部全銜改為「軍管區司令部兼海岸巡防司令部」其主要任務為負責後備軍人管理、動員、服務及台澎地區海岸巡防，戰時兼負警備作戰為因應解除戒嚴及政治環境邁入民主憲政趨勢，政訓處配合更名為後備軍人服務處，各師、團管部增設後備軍人服務組（科），同時改隸軍事幕僚體系，任務及工作性質不變，仍由政戰主管督導，復於民國八十九年十一月一日配合「輔導組織」調適回歸軍事幕僚體系督導，持續推動各項後備軍人組訓、服務等工作迄今。
■89年—91年（2000～2002），軍管區司令部
民國八十九年一月，立法院三讀通過「海巡法」，於同年（八十九年）二月一日軍管、海巡分置，海巡單位移編新成立之「行政院海巡署」，本部恢復銜稱為「軍管區司令部」，主要掌理動員、管理、服務三大工作及戰時警備治安。「國防組織法」於民國八十九年一月二十九日總統明令公佈後，本部銜稱依該法第十條規定，修定「國防部後備司令部」 ，並配合「國防二法」 於九十一年三月一日實行時，同時更名。
■91年—93年（2002～2004）， 後備司令部
民國九十一年三月一日；本部銜稱修訂為「後備司令部」，主要任務為策劃執行動員、管理、服務、民防工作、建立後備潛力，同時「師管部」 修訂為「地區後備司令部」；「團管部」修訂為「縣市後備司令部」。民國九十三年四月一日起，配合「精進案」高司幕僚組織調整，政治作戰部所轄各「處」調整為「組」，作戰計畫處更名為「訓練處」。另結合「常後分立」後備部隊編組調整，接收陸軍移編八個海岸守備（新訓）旅、九個衍生營、七個補充兵營、陸戰隊移編訓練中心；原二十一個後備旅調整編成四個海岸守備（前推）旅及十七個城鄉守備旅；原五十五個山地連減併為二十九個及維持五個高山站台連，全案於九十三年十二月三十一日完成。
■93年—94年（2004～2005）， 後備司令部
為貫徹「精進案」整體規劃構想，使編制員額趨近現員結構之政策指導，採組織小幅調整、編組型態單純化、編裝力求一致性，有效執行現行任務原則。自九十三年起訖九十五年止區分三年執行，除九十三年依預定執行目標完成外，後續精簡目標提前於九十四年完成。司令部一級幕僚單位「動員處」、「後備軍人管理處」簡併為「動員處」；保留藝術工作隊，並於94年8月移編國防部總政治作戰局；新增「國軍人才招募中心」，編設為本部一級幕僚單位。
■94年—95年1月（2005～2006.01）， 後備司令部
司令部政治作戰主任室，新增「公共事務組」，軍紀監察組移編「督察室」；國會連絡業務移至政戰主任室；各幕僚單位文書檔案人力集中編成「文書管理組」，機要文書組、國會事務組併編「機要事務組」；訓練處修訂銜稱為「戰備訓練處」；動員處修訂銜稱為「動員管理處」；後備軍人服務處業務改由政戰主任督導；原「國軍人才招募中心」配合本部辦事細則法規制定，修訂銜稱為「國軍人才招募處」，各地區人才招募中心改隸為地區司令部；「保防安全組」，修訂銜稱為「軍事情報處」；原聯合後勤司令部「留守業務署」編組體系及業務移編本部，修訂銜稱為「留守業務處」。
原文出處 雲程